Zalążkiem obecnego Zespołu Szkół była Publiczna Szkoła Powszechna Nr 1, która powstała w 1945 roku i mieściła się przy ulicy A. Mickiewicza (obecny budynek Szkoły Podstawowej Nr 2. Pracę z 64 uczniami rozpoczęło 3 nauczycieli pod kierunkiem Zofii Stefańskiej. Od stycznia 1947 roku szkołą zarządza Bolesław Jasiński (nauczyciel języka rosyjskiego). W 1948 roku szkoła zostaje przeniesiona do budynku przy dzisiejszej lokalizacji - ulica Chrobrego 13. Przenosiny te zapoczątkowały możliwość rozwoju szkolnictwa średniego - bowiem utworzono dwie pierwsze klasy realizujące program szkoły średniej - klasę VIII i klasę IX.
1950 rok- szkoła na mocy zarządzenia ówczesnego Ministerstwa Oświaty i Wychowania ulega reorganizacji i przyjmuje nazwę Państwowej Szkoły Ogólnokształcącej stopnia podstawowego i licealnego. Kieruje nią Jadwiga Stasiun- nauczycielka historii (1950-1953r.). Taka nazwa szkoły funkcjonuje aż do lat 60-tych XX wieku. Stosowano często nazwę 11-letniej szkoły stopnia podstawowego i licealnego. Kolejni dyrektorzy szkoły to: Zbigniew Ostrowski- nauczyciel historii (1953-1958r.), Jan Matykajtys- nauczyciel matematyki (1958-1960r.), Taduesz Zienkiewicz- nauczyciel języka polskiego (1960-1967r.).
Rok 1964/65 jest kolejnym punktem zwrotnym w reorganizacji Szkoły Ogólnokształcącej stopnia podstawowego i licealnego - ten ostatni jest dojrzały do samodzielnej egzystencji. W latach 60-tych powstaje już drugi ciąg w klasach VIII, a stopień licealny zostaje oddzielony od stopnia podstawowego. Dotychczasowa Publiczna Szkoła Powszechna staje się samodzielną jednostką i przyjmuje nazwę Liceum Ogólnokształcącego. W 1973 roku aktem prawnym zostaje jej nadane imię Komisji Edukacji Narodowej. Na stanowisku dyrektora szkoły zasiada Marian Pieklik -nauczyciel matematyki, który kieruje szkołą w latach 1967- 1972. W kolejnych latach funkcję tę przejmuje Mieczysław Michałowski - nauczyciel historii (1972-1981r.)
Rok 1975 - Kuratorium Okręgu Szkolnego powołuje zbiorczy zakład szkolny - zaczyna funkcjonować nazwa Zespół Szkół w Biskupcu.
W roku 1981 działalnością placówki zaczyna kierować Ryszard Zieliński (nauczyciel wychowania fizycznego) i pełni tę funkcję do roku 2007. Po przejściu na emeryturę dyrektora Zielińskiego zastępuje nauczyciel chemii Krzysztof Karmazyn, która był dyrektorem w latach 2007- 2014. Od roku szkolnego 2014/2015 na stanowisku dyrektora pracuje Krzysztof Janczara (nauczyciel historii).